因宗教纷争所引起的战争。如十六、十七世纪欧洲宗教改革后，西班牙国王派遣无敌舰队征英之役，其藉口便是扞卫旧教，讨伐新教。三十年战争更为惨烈，因神圣罗马帝国皇帝压迫境内新教活动，遂由内战演变成国际性战争，所幸战后各国签订条约，确立了宗教信仰自由的原则，并承认各新教教派的独立地位。